Ich výskum ocenili aj v Cambridge: Daniel a Lukáš získali 40 000 eur na vývoj unikátneho nástroja pre vedcov

  • Startup Carta Genum vyvíja virtuálneho bioinformatika
  • Biológom má uľahčiť analýzu dát bez potreby programovania
Carta Genum
  • Startup Carta Genum vyvíja virtuálneho bioinformatika
  • Biológom má uľahčiť analýzu dát bez potreby programovania
ČLÁNOK POKRAČUJE POD REKLAMOU

Startup Carta Genum, ktorý sa špecializuje na priestorovú biológiu, získal pre-seed investíciu vo výške 40 000 eur od fondu Czech Founders VC. Okrem toho sa stal súčasťou prestížneho akceleračného programu Sherpa.

Cieľom mladého tímu je zásadne zjednodušiť prácu biológov s komplexnými dátami a sprístupniť im analytické nástroje bez potreby písania kódu.

Zrýchliť objavy vďaka intuitívnej analýze

Priestorová biológia patrí medzi dynamicky rastúce oblasti modernej vedy. Práve vďaka nej dokážu výskumníci pochopiť, ako sa bunky správajú v kontexte svojho prostredia, čo je kľúčové napríklad pri výskume rakoviny alebo vývoji imunoterapie. Tento výskum však generuje obrovské objemy dát, ktorých analýza je mimoriadne náročná na čas, odborné znalosti a technologické zázemie.

Biológovia sa tradične musia spoliehať na pomoc bioinformatikov, čo prináša nové výzvy. Výskumník často nie je schopný operatívne testovať hypotézy, pretože nie je sám schopný pracovať s dátami bez pomoci programátora. Tím Carta Genum sa preto rozhodol tento problém vyriešiť vývojom nástroja, ktorý umožní odborníkom analyzovať dáta priamo prostredníctvom prirodzeného vedeckého jazyka.

Veríš, že mladé technologické startupy ako Carta Genum dokážu reálne zmeniť spôsob robenia výskumu vo vede?

„Nestaviame čiernu skrinku, ktorá len vypľuje výsledok. Kľúčový je pre nás princíp ponechania experta v centre rozhodovania, takzvaný human-in-the-loop. Biológ má expertné znalosti, ktoré ani ten najlepší algoritmus nedokáže nahradiť. Naša platforma a AI agenti mu len odstránia bariéru v podobe písania kódu. Umožníme mu klásť otázky typu ‚Kde sa zhlukujú bunky s týmto génom?‘ namiesto zložitého nastavovania parametrov,“ vysvetľuje spoluzakladateľ startupu Daniel Žucha.

Od služby k produktu

Za projektom stoja výskumníci Lukáš Valihrach a Daniel Žucha, ktorí dlhé roky pôsobili v Biotechnologickom ústave Akadémie vied Českej republiky. Svoje know-how najprv ponúkali ako analytickú službu pre iné výskumné tímy, no narazili na limity škálovania takéhoto prístupu. Aj keď spolupracovali s renomovanými inštitúciami ako SOTIO Biotech či University of Cambridge, uvedomili si, že ručná práca nie je udržateľná, ak chcú svoj dosah znásobiť.

„Spolupráca so špičkovými pracoviskami, ako sú SOTIO Biotech alebo University of Cambridge, nám potvrdila, že o naše know-how je záujem. Zároveň sme si však overili, že manuálna analýza má svoje limity. Nemôžeme naklonovať sami seba. Preto sme sa rozhodli zmeniť stratégiu a vyvinúť produkt, ktorý naše postupy automatizuje,“ uviedol Lukáš Valihrach.

Ich cieľom je vybudovať platformu založenú na vlastnom analytickom systéme – takzvanom Biologist-Oriented Framework. Ten transformuje zložité štatistické výstupy na zrozumiteľné odpovede na biologické otázky. Konečným cieľom je nasadiť virtuálneho bioinformatika, ktorý bude s vedcami komunikovať prirodzeným spôsobom a zároveň im poskytne kontrolu nad interpretáciou výsledkov.

Investícia, ktorá má vedecký význam

Vstup Czech Founders VC do startupu prináša nielen finančnú injekciu, ale aj výraznú validáciu ich prístupu. Investičný fond vidí v projekte obrovský potenciál a ocenenie si startup vyslúžil aj zo strany Středočeského inovačného centra, ako aj vďaka účasti v medzinárodnom programe MARC Impact Programme pre spoločensky významné technologické riešenia v regióne strednej a východnej Európy.

„Carta Genum rieši pálčivý problém v rýchlo rastúcom odvetví. Lukáš a Daniel majú unikátnu doménovú expertízu a jasnú víziu, ako sprístupniť zložitú analýzu širšej vedeckej komunite. Práve demokratizácia prístupu k dátam je to, čo môže celý odbor posunúť skokovo vpred,“ uviedol Ivan Kristeľ, spoluzakladateľ a General Partner v Czech Founders VC.

V najbližšej fáze vývoja sa tím sústredí na implementáciu technickej infraštruktúry a vývoj vlastného frameworku, ktorý umožní integráciu umelej inteligencie do analytických procesov. Prvým krokom bude pilotné nasadenie platformy vo vybraných výskumných centrách, kde si startup overí praktickú použiteľnosť nástroja v každodennom výskume.

Výskum, ktorý už prináša výsledky

Aj napriek ranej fáze vývoja má Carta Genum za sebou prvé úspechy. Ich analytické služby prispeli k štúdii publikovanej v prestížnom Journal for ImmunoTherapy of Cancer. Výskum, na ktorom sa podieľala aj česká biotechnologická firma SOTIO Biotech a výskumníčka Anna Fialová, skúmal takzvané terciárne lymfoidné štruktúry (TLS) v rôznych typoch rakoviny.

Zatiaľ čo vysoký výskyt TLS zvyčajne predpovedá priaznivý priebeh ochorenia, výskum ukázal, že to neplatí pri rakovine krčka maternice. V tomto prípade sa totiž TLS stávajú tzv. „chladnými zónami“ – sú síce početné, no ich funkciu narúšajú regulačné T-bunky a ďalšie supresívne bunky.

„Pomocou Xenium spatial transcriptomics – s analýzou dát, na ktorej sa podieľal náš tím – sme potvrdili, že TLS v prípade rakoviny krčka maternice sú obohatené o génové podpisy vyčerpania T-buniek a potlačenia imunitnej odpovede,“ uviedol tím Carta Genum na sociálnej sieti LinkedIn.

Veda bez bariér

Startup Carta Genum ukazuje, ako môže prepájanie bioinformatiky a umelej inteligencie odomknúť potenciál vedeckých dát, ktoré dnes zostávajú často nevyužité kvôli technickej zložitosti ich spracovania. Vďaka podpore investorov a strategickému posunu od služby k produktu majú ambíciu demokratizovať prístup k dátam a umožniť rýchlejšie objavy naprieč biologickými disciplínami. Vďaka ich prístupu môže byť budúcnosť biomedicínskeho výskumu viac než len technologická. Môže byť oveľa dostupnejšia. 

Čítaj viac z kategórie: Biznis a startupy

Najnovšie videá

Trendové videá